清朝咸丰年间，邓少先出任江苏南通狼山镇总兵。邓少先虽然妻妾成群却没有一个儿子，唯有爱妾郑氏生有一女，因出生在七月初七乞巧节，遂取名“巧姑”。巧姑出生后，郑氏再也没有怀孕，邓总兵从此把对子女的爱全都集中在巧姑身上。
巧姑十岁这一年，邓总兵以千金聘请江右名士孙荇州为巧姑老师。孙先生家住距狼山镇不远的唐闸，他中年丧妻，无依无靠，遂将外甥李耀宗收为养子，改名“孙耀宗”。孙耀宗这一年12岁，亦随养父一起到邓总兵家，做了巧姑的陪读生。
光阴荏苒，转眼巧姑已经16岁，出落得亭亭玉立，光艳照人。加之她陪颖好学，四书五经。棋琴书画无不通晓，她父亲又身居总兵之职，慕名前来担亲的人络绎不绝。可是，几十个有权有势的有钱财公子哥儿们，巧姑竟无一相中。细心的母亲这才发现原来女儿早已有了意中人，他就是孙耀宗。
邓总兵知道这个消息后非常生气，说：“我乃堂堂一镇总兵，又只有这么一个掌上明珠，岂能随便把女儿嫁给一个穷书生。这件事我绝不会答应。”为了让巧姑死了这份心，邓总兵以巧姑学业已成，不需要再继续教书为由辞退了孙先生。
孙耀宗回家的当天的晚上。巧姑就病倒了。邓总兵开始以为女儿患了感冒，并没太再意。不曾想一连请了镇上几个名医，吃了不少汤药，巧姑的病非但没有丝毫减轻反而越来越严重了。眼看着好端端的一个人只几天时间便双目无光，面黄肌瘦，最后竟至茶饭不思，，邓总兵这才慌了手脚，连忙同郑氏商量办法。
女儿的病郑氏心里最清楚，她告诉邓总兵说：“巧姑的病十有八九与孙耀宗回家有关。俗话说，角铃还需系铃人，女儿的病除了孙耀宗恐怕没人能治得了。我看不是依了她，成全她们的婚姻吧。这都是命中注定的。”邓总兵闻言沉思良久，事关女儿性命，他不得不做出让步。
事不宜迟，邓总兵立即派两名统领火速到达唐闸镇，告诉孙荇州，说邓总兵愿意把女儿话配给孙耀宗，靖他马上派人携聘礼到邓总兵家求亲。
亲事就这样定下来了，巧姑的病也果然痊愈了，邓总兵和郑氏自然是欣喜异常。经两家协商，决定在明年春天为巧姑和孙耀宗完婚。
话说孙耀宗新婚大喜的前一天，孙荇州父子提前来到狼山镇，先暂时住在一家旅店里。第二天一大早，孙耀守即乘彩轿前往总兵府迎接新娘。眼看快要到达总兵府生大门前，孙耀宗远远看见总兵府衙岗哨林立，戒备森严，官差衙役们进进出出，匆匆忙忙，十分混乱，一点也没有办喜事的样子。
到底发生了什么事情？孙耀宗连忙停下轿来打听。这一打听不要紧，差点没把孙耀宗吓死。原来，昨天晚上邓总兵被人刺死，而凶手不是别人，正是邓总兵最宠爱的郑氏。孙耀宗心想，出了人命案，非但新娘娶不成，贸然前往恐怕还会受到牵连。三十六计，走为上。想到这里，孙耀宗连忙调转轿头，返回住处。
当天晚上，孙耀宗出门打探消息，得知郑氏已被官府押解到金陵，巧姑已经投河自杀了。提知巧姑已死，孙耀宗痛不欲生。多亏孙荇州好言相劝，孙耀宗的情绪这才稍微好了一些。令孙荇州父子百思不得其解的是，他们在邓家住了七、八年，深知邓总兵非常恩爱，郑氏怎么可能忍心下毒手谋害亲夫呢？莫非有人巡视于她？为了把事情弄个水落石出，孙荇州父子决定到金陵去探监。
来到金陵后，孙荇州父子通过熟人，见到了身陷囹圄的郑氏，郑氏这才将事情的原委一五一地告诉孙荇州父子。
原来郑氏娘家本姓吴，出嫁后才随夫改郑。郑氏的婆家是川西方圆百里出了名的富户。当时，率军驻扎在川西的邓少先觊觎郑家财产，于一天深夜派部下悄悄地杀了郑氏一家大小十几口人，抢走了郑家全部金银财宝。新婚不久的郑氏因藏在草堆里而幸免于难。
天亮后，邓少先又假装因事路过，亲自到郑郑家查看，发现了年轻漂亮的郑氏，顿时起了贼心。他假装好人，对邓氏好言相舅，倍加关心，又派人厚葬了郑家老小十几口人的遗体。家遭大难，郑氏本不想苟活于人世，但她已身怀郑家骨血，为了不使郑家断了香火，日后也有人能为郑家报仇雪恨。加之邓家遭大难在先，邓少先施恩在后，郑氏没有看出邓少山的目，反而对他感恩戴德。于是，，同意嫁给邓少先，婚后六个月就生下了巧姑。
巧姑出嫁的前一天，郑氏收拾巧姑嫁时，无意中夺箱子里发现了她前夫身上佩戴的一块汉白玉佩，婆婆身上戴的金银首饰，顿时起了疑心。便追问这些东西的来历，邓少先当时正好多喝了几杯酒，随口说道：“这是四川一富豪家的物品，我派人动杀他全家后抢来的。”郑氏这才恍然大悟，一言不发，低着头默默地离开了。
当天晚上，邓少先来到郑氏房间，由于白天喝酒太多，天黑没多久就蒙头大睡，郑氏却翻来覆去怎么也睡不着。她怎么也没有想到和她同床共枕了18年的丈夫竟然是她不共戴天的仇人。经过一番激烈地思想斗争，郑氏最终足勇气，拿起剪刀，对着熟睡中的邓少先喉管狠狠地扎下了去......
杀了邓少先后，郑氏来到女儿巧姑房间，满含热泪讲述了巧姑的身世以及她已经杀了邓少先的消息。巧姑听罢，心里真像打翻了五味瓶，不知道是什么滋味。事已至此，她也无话可说。她深知杀了总兵，追究起来自己免不了也要受到牵连，与其公堂受辱，不如一死了之。因此，天亮后巧姑趁总兵府内一片混乱之机跑到江边，投江自尽。官府知道后派人打捞巧姑尸体，由于江水流得太急，始终没有找到。
事情已经到了这般田地，孙荇州父子也只好作罢，悻悻地回到唐闸老家。
是年秋，郑氏以谋害朝廷罪被凌迟处死。
一年后，孙荇州不幸病故，族人们想独占孙家财产，硬说耀宗姓李不姓孙，没有资格继承孙家财产，势单力薄的耀宗斗不过族人，只好又回到平湖他父母身边，复姓为李，继续发愤读书。
又过了几年，李耀宗参加乡试，一举夺魁，中了举人。主考官藩文恭看中了耀宗的人品和才华，欲将女儿话配给耀宗，托媒人向耀宗提亲。自从巧姑死后，耀宗早已心恢意冷无意婚娶。但父母却自做主张，答应了这门亲事。耀宗无力反抗父母之命，只好顺其自然，听天由命，
却说耀宗新婚大喜之日，家里高朋满座，门前车水马龙，好不热闹。然而，此时此刻，耀宗思念着巧姑，独自一人坐在墙解暗自垂泪，直到花轿来到门前，才被人拉出去迎接新娘。谁知耀宗揭开轿帘朝里一看，大家都傻了眼。原来新娘头顶盖头，以丝巾系颈，吊死在轿内。众人一阵忙乱，解下新娘脖子上的丝巾，救下了新娘。
由于新娘上吊时间短，加之轿内高度不够，大约过了一个时辰，新娘又慢悠悠地醒了过来。恰在此时，耀宗来到屋内看望新娘，四目相对，两人不约而同地惊叫道：“怎......么......会是你？”
原来，新娘不是别人，正是当年投江自尽的巧姑。
那日，巧姑投江后，适逢潘文恭乘船从她投江的地方经过，连忙命人把她救了上来。待巧姑醒来后，潘文恭问明情况后，见巧姑陪明巧，人长得又漂亮，有意将她收为养女。无家可归的巧姑只好做了潘文恭的义女，随潘文恭而去。生活安定下来后，巧姑曾让潘文恭托人到唐闸打听耀宗的下落，只因耀宗早已返回平湖老家，并复姓为李，所以一直没有结果。
当潘文恭告诉巧姑要把她话柄给李举人时，巧姑有心不答应，又不忍心辜负养父救命之恩和一番好意，只得勉强答应。
出嫁这一天，巧姑思念耀宗，伤心至极。思前想后，决定以死来表示她对耀宗的深情厚意。于是，她在轿内悄悄地解下脖子上的丝巾，系在轿顶上，上吊自杀。多亏抢救及时，这才捡回一条命。她做梦也没有想到她醒来后，睁开眼睛看到的第一个人竟然是她朝思暮想的耀宗哥。
就这样，巧姑曾一度差点儿病死，又两度自杀，两度被人救起，最后阴差阳错，终于与她深深相爱的人结成了百年之好，真是一件千古奇事。